Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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