Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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