Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
HOXA13P31271 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXA13P31271 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms