Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SMG9Q9H0W8 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms