Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TM6SF1Q9BZW5 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms