Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GTF3C6Q969F1 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms