Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms