Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIP13Q15645 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms