Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms