Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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FOXF1Q12946 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXF1Q12946 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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