Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PTPN13Q12923 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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