Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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PTPRMP28827 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRMP28827 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRMP28827 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRMP28827 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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PTPRMP28827 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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