Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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