Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PRKCHP24723 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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