Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms