Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CDKN3Q16667 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms