Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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CHAF1AQ13111 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CHAF1AQ13111 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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