Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC068898.2-201ENST00000514425 597 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC01886-202ENST00000443205 1539 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AP003716.1-202ENST00000511677 3387 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TKTL2-201ENST00000280605 2654 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 GLDCP1-201ENST00000510885 2678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC01278-205ENST00000609401 2886 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 GPNMB-202ENST00000381990 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL365217.1-201ENST00000398578 2436 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ENTPD1-203ENST00000371207 1903 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
FOXC1Q12948 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms