Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1Q9Y3L3 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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