Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CIPCQ9C0C6 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CIPCQ9C0C6 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CIPCQ9C0C6 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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