Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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GTF3C6Q969F1 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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GTF3C6Q969F1 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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GTF3C6Q969F1 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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GTF3C6Q969F1 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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GTF3C6Q969F1 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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