Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
UBXN4Q92575 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms