Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VPS72Q15906 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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