Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms