Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RFTN1Q14699 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RFTN1Q14699 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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RFTN1Q14699 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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RFTN1Q14699 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFTN1Q14699 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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