Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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