Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TM6SF1Q9BZW5 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms