Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms