Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TCIRG1Q13488 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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TCIRG1Q13488 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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