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| FOXE3 | Q13461 | SGO2-201 | ENST00000357799 | 4214 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PHLDB2-211 | ENST00000481953 | 5474 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ICE2P1-201 | ENST00000512800 | 1849 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR2L13-203 | ENST00000641893 | 1817 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMPRSS15-201 | ENST00000284885 | 3947 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KLF7-201 | ENST00000309446 | 8362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IARS-206 | ENST00000447699 | 4186 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | UTP4-204 | ENST00000563094 | 4183 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NCAPG2-202 | ENST00000409339 | 5253 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RGPD3-201 | ENST00000304514 | 5510 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RAB5B-201 | ENST00000360299 | 5340 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC008560.1-201 | ENST00000510585 | 1766 nt | APPRIS P5 TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FGF10-201 | ENST00000264664 | 2193 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAMTS3-204 | ENST00000622135 | 4479 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC022075.1-201 | ENST00000500682 | 2830 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LIMA1-202 | ENST00000394943 | 3669 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CEP152-201 | ENST00000325747 | 4986 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MED23-201 | ENST00000354577 | 4581 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PSG6-201 | ENST00000187910 | 1674 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL023495.1-201 | ENST00000413005 | 1923 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CDKL4-202 | ENST00000395035 | 1140 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LINC02257-201 | ENST00000412445 | 605 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL034397.2-201 | ENST00000424241 | 857 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL008723.2-201 | ENST00000426354 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNX19-202 | ENST00000426933 | 888 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL356364.1-201 | ENST00000458443 | 182 nt | TSL 3 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | UCK2-206 | ENST00000470820 | 1083 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL079303.1-201 | ENST00000486611 | 463 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC021006.1-201 | ENST00000489849 | 553 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC091826.2-201 | ENST00000504034 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC091860.2-201 | ENST00000509423 | 941 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL158068.2-201 | ENST00000510632 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KRT19P6-201 | ENST00000510983 | 209 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LECT2-203 | ENST00000512872 | 762 nt | TSL 5 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-943P-201 | ENST00000516960 | 98 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEPT10P1-201 | ENST00000517342 | 1162 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL445383.1-201 | ENST00000554689 | 874 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL121579.1-201 | ENST00000555129 | 305 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HNRNPCP1-201 | ENST00000556181 | 766 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC109462.2-201 | ENST00000558730 | 763 nt | TSL 3 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIR378H-201 | ENST00000579966 | 83 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |