Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms