Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms