Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRBV2A0A0J9YWF9 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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