Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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