Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SGF29Q96ES7 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SGF29Q96ES7 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms