Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NEDD1Q8NHV4 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms