Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NRF1Q16656 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms