Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC073862.2-201ENST00000625114 701 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF132-203ENST00000639285 1200 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC004129.1-201ENST00000417617 796 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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VAMP3Q15836 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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