Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 GALR1-201ENST00000299727 10044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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