Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXA13P31271 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms