Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PTPRMP28827 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
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