Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CTLA4P16410 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTLA4P16410 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms