Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SP6Q3SY56 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms