Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TAF1AQ15573 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms