Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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