Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 GSTA5-202ENST00000370989 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 SNORD83A-201ENST00000386747 95 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 TISP43-205ENST00000440359 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL391987.3-201ENST00000441101 719 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC02160-201ENST00000503577 517 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 MICE-207ENST00000510438 1157 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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MKRN4PQ13434 AP000916.2-201ENST00000528904 286 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC137800.1-202ENST00000562098 446 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MKRN4PQ13434 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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