Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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GRIK2Q13002 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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GRIK2Q13002 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
GRIK2Q13002 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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