Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms