Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXF1Q12946 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXF1Q12946 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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