Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ACADSBP45954 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms