Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
UBXN4Q92575 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms